刘宋元嘉八年(431年)，酂、銍2个县改属历阳郡(治历阳，今和县历阳镇)，南谯郡仅领3个侨县。升明三年(479年)四月，南齐代宋，地改属南豫州(仍治故钟离城)，南谯郡(治山桑故城，名南谯城，今全椒县襄河镇北)，领曲阳、山桑、扶阳3个侨县。酂县改属临江郡(治今和县乌江镇)。 历史沿革
东晋永昌元年（322年），在今安徽全椒县城北1公里尹村侨置南谯郡，初治于山桑，领有山桑、南谯、酂、扶阳、銍等县，属徐州。晋孝武帝太元元年（376年），桓冲将谯国流民置于庐江郡境内的浣川，侨置谯国，后改为谯郡。晋安帝义熙十一年（415年），国除为谯郡。宋武帝永初元年（420年），谯郡更名为南谯郡。随后，南谯郡多次隶属于不同的州，包括豫州、南豫州等。梁武帝时期，南谯郡移治至蕲县谯 郡城，改属合州。至北周静帝大象元年（579年），南谯郡被废除。 人口
宋孝武帝大明八年（464年），南谯郡户籍统计为4432户、22358人。