藤原种继（737年-785年11月4日）是日本奈良时代末期的公卿，藤原式家之祖藤原宇合的孙子，藤原清成的长子。他的官位是正三位、中纳言，后来被追赠为正一位、太政大臣。 简介
《续日本纪》第一次记载藤原种继是在766年（天平神护2年）由从六位上升为从五位下，同时叙爵的人还有和气清麻吕。 2年后出任美作守，之后历任近卫少将、纪伊守、山背守、左京大夫、下总守、左卫士督、近江守。由藤原式家所拥立的光仁天皇即位后，藤原式家的政治影响力上升，藤原种继的官位也随之上升。特别在藤原种继的叔父藤原良继、藤原百川去世后，藤原种继成了藤原宇合的众孙之中的最年长者，成为藤原式家的代表。桓武天皇将藤原种继非常信任，视之为心腹。藤原种继是迁都长冈京的策划者和执行者。782年（延历元年）藤原种继出任参议、式部卿，784年（延历3年）出任中纳言。 785年（延历4年）藤原种继被反对迁都的贵族暗杀。以藤原种继暗杀事件为契机，早良亲王被指为慕后黑手，在流放之时，绝食抗议而死。著名诗人大伴家持也被指为主谋，死后不被允许下葬。