真蕨亚门（拉丁学名：Filicophytin）是现代最繁茂的一群蕨类植物，约有1万种以上，广布全世界；中国近2000种，广布全国。孢子体发达。茎除了树蕨外，均为根状茎，有各式中柱。木质部主要成分为管胞，少数具导管。叶为大型叶，幼叶拳卷状，长大后平展，分化为叶柄和叶片二部分。叶片为单叶或一至多回羽状分裂或复叶。孢子囊常聚集成孢子囊群生于叶边缘或背面，也有的生于特化了的孢子叶上，有或无囊群盖，孢子同型，一些水生真蕨的孢子囊则生于特化的孢子果内，孢子异型。配子体为心脏形的叶状体，长宽一般不超过1厘米，绿色，有假根。精子器和卵器均生于腹面。根据孢子囊的发育方式、结构及着生位置等，可分为厚囊蕨纲Eusporangiopsida、原始薄囊蕨纲Protolyptosporangiopsida和薄囊蕨纲Leptosporangiopsida。 形态特征
孢子体发达，有根茎叶分化。根为不定根。茎为根状茎（树蕨类具直立茎）；中柱类型：原生中柱、管状中柱、多环网状中柱茎表面有鳞片与毛；毛：单细胞毛、节状毛、星状毛；鳞片：粗筛孔鳞片、细筛孔鳞片叶：大型叶，幼叶拳卷。分化为叶柄与叶片。单叶或复叶：单叶叶片不分裂或浅裂；复叶叶片多分裂或叶柄上生有分离的小叶。孢子囊聚集为各式孢子囊群。真蕨作为蕨类的代表植物，世代交替非常明显。从合子起，染色体是2N，便是孢子体世代开始。受精卵在颈卵器中发育成胚，胚发育成幼小的孢子体。孢子体具明显的根。茎、叶能进行独立生活。叶背生孢子束，孢子束内的孢子母细胞经减数分裂，产生单倍体N的孢子，便是配子体世代或有性世代的开始。这种孢子萌发长成心脏形的原叶体(配子体)。原叶体上产生精子器和颈卵器。内有精子、卵，精卵结合产生合子，合子萌发形成孢子体。这样从无性世代的孢子体产生有性世代的配子体，又从有性世代的配子体产生无 性世代的孢子体，无性世代与有性世代相互更替，称为世代交替。 物种分类
主要类群：真蕨约1万种。