西南大学蚕学与系统生物学研究所是由1993年批准成立的农业部蚕桑学重点实验室以及2000年成立的重庆市首批蚕桑学重点实验室发展建成，并在2005年组建教育部蚕学与基因组学重点实验室，同时进入“211”重点建设学科。目前，研究所已经发展成为我国蚕桑学基础和应用基础研究、产业技术研发和高级专门人才（硕士、博士）培养的重要基地。研究所所在的“特种经济动物饲养学科”于2002年被评为国家重点学科。 简介
中国工程院院士、国际著名蚕学家向仲怀教授任研究所所长和学术委员会主任。研究所下设家蚕基因库及遗传育种研究室、桑遗传育种研究室、桑蚕病虫病理研究室、分子生物学及遗传工程研究室、细胞生物学研究室及应用生物工程研究室等六个研究室。研究所主要研究方向和内容：以家蚕基因组生物信息学、家蚕重要功能基因研究、转基因和分子改良技术体系建立为主的家蚕功能基因组研究为核心，以蚕、桑新 素材创新、新品种选育和现代蚕桑产业技术研发提升产业技术水平为目的，开展家蚕模式昆虫和家蚕生物反应器等研究拓展学科领域和非绢丝产业领域。 研究所拥有一支以中国工程院院士、长江学者、国家级有突出贡献的中青年专家、省部级专家为主要阵容的学术队伍。目前研究所专职研究人员25人，其中教授9人，副高12人，有博士学位者16人；中国工程院院士1人，长江学者1人，博士生导师7人，国家有突出贡献的专家4人，国家“百千万人才工程”人选3人，“跨世纪优秀人才”和“新世纪优秀人才”各1人，“973” 项目首席科学家1人。实验室常年在读硕博研究生130人左右，在站博士后3～5人。