为规范发展公益事业，阿里巴巴集团及旗下子公司联合成立的“阿里巴巴公益基金会”已于2011年通过国家民政部批准审核批准，马云成为该基金会第一号志愿者。 2010年5月，阿里巴巴集团宣布从2010年起将集团年收入的0.3%拨作公益基金，主要用于环境保护，是国内互联网企业首家环境保护基金。
阿里巴巴公益基金会的宗旨是：营造公益氛围，发展公益事业，促进人与社会、人与自然的可持续发展。资助重点包括：水环境保护，环境保护宣传，以及支持环保类公益组织的发展。 阿里巴巴公益基金会的公益观是我们相信的：人人都有社会责任，在网络化的便捷环境下，人人也有能力履行社会责任；我们确信：社会责任对企业不是负担，在每一家企业的商业模式中，都可以找到自身与社会责任的结合点；我们坚信：企业社会责任应内生于企业的商业模式，惟其如此才能实现可持续发展。