1994年7月30日，按照国务院关于建立分税制财政管理体制的要求，吉林省地方税务局正式组建，是吉林省人民政府主管地方税收工作的直属机构。 其主要职能是贯彻执行国家税务政策，编制全省地方税收长远规划和年度税收计划，制定地方税收的具体措施，加强全省税收机构的行政管理与机构编制等诸项事务。
2018年6月15日，新组建的国家税务总局吉林省税务局举行挂牌仪式，标志着原吉林省国家税务局、吉林省地方税务局正式合并。[1][2] 内设机构
2005年9月吉林省地方税务局机关机构调整后，设有：办公室、政策法规处、征收管理处、财务审计处、流转税管理处、所得税管理处、财产与行为税管理处、发票管理处、税收服务处、计划统计处、人事处、基层工作处等12个职能处室及监察室、机关党委、计算机信息中心、票证管理中心、机关服务中心、长春直属征收分局、稽查局、国际税收研究会共20个处级单位。