菲律宾伊斯兰教是13世纪下半叶传入菲律宾的宗教。主要组织有菲律宾穆斯林协会(马尼拉)、菲律宾伊斯兰教协会(马拉威)、菲律宾伊斯兰皈依者协会(马尼拉)、菲律宾穆斯林联盟。主要政党有摩洛民族解放阵线(即摩解)、菲律宾穆斯林团结党。其中以摩洛民族解放阵线影响最大，建有武装，自1960年起长期领导穆斯林分离主义运动，主张建立自治的“摩洛民族共和国”。 发展历史
菲律宾多属马来人种(史称摩洛人)，包括陶索格、马京达瑙、马拉瑙、伊拉农等民族。13世纪下半叶，伊斯兰教随阿拉伯商人传入菲律宾。其后，印尼穆斯林移民又在南部诸岛传播伊斯兰教。14～16世纪，在南部和马尼拉相继兴起苏禄、马京达瑙、棉兰老和马尼拉4个苏丹国。16世纪下半叶，西班牙殖民者入侵并建立殖民统治，扼阻了伊斯兰教向北部传播的势头。菲律宾穆斯林多属逊尼派，遵循沙斐仪教法学派。 教派规模
80年代末，经过谈判，与政府的关系趋于缓和。全国约有200～300座清真寺，主要建在南部，马拉威城的棉兰老伊斯兰中心清真寺久负盛名。有1000多所经文学校。马拉威城的菲律宾伊斯兰研究学院为宗教教育的最高学府，棉兰老省立大学也开设有关伊斯兰研究、阿拉伯语的专业学科。南部一些穆斯林聚居地区实行伊斯兰教法。菲律宾穆斯林协会是 世界伊斯兰大会成员，与 伊斯兰世界联盟多有联系。