单核苷酸多态性

生物学术语
核苷酸多态性(single nucleotide polymorphism,SNP)是指在基因组水平上由单个核[gān]酸的变异而形成的DNA序列多态性,是继短串联重复序列(STR)、数目可变串联重复序列(VNTR)为代表的第2代DNA遗传标记基础上发展起来的第3代遗传标记。单核苷酸多态性具有分布广、数量多和高保守的特点。人类许多表型差异,个体对药物的反应以及遗传性疾病都与单核苷酸多态性密切相关。[1]
单核苷酸多态性是人类可遗传的变异中最常见的一种,占所有已知多态性的90%以上。单核苷酸多态性在人类基因组中广泛存在,平均每500至1000个碱基对中就有1个,估计其总数可达300万个甚至更多。[2]单个核苷酸的变异是由单个碱基的转换或颠换、插入或缺失所致。所以单核苷酸多态性是一种二态的标记,即二等位基因[3]单核苷酸多态性可以发生在基因的编码区,也可以出现在基因的非编码区或基因间序列。[4]
单核苷酸多态性在遗传学诊断、药物基因组学、疾病易感性研究、生物学的进化以及遗传育种等领域有着广泛的应用。[1]

知识介绍

SNP所表现的多态性只涉及到单个碱基的变异,这种变异可由单个碱基的转换(transition)或颠换(transversion)所引起,也可由碱基的插入或缺失所致。但通常所说的SNP并不包括后两种情况。