本区呈东西宽南北窄的长条形，东半部属中央山脉的一部分，地势较为崎岖，西半部则属嘉南平原，地势平坦，气候属热带季风气候。 历史沿革
六甲区的地名由来与拓垦时期的土地面积计算有关。明郑时期，郑成功部将陈永华招募开垦此地，先后开辟了二甲、三甲、四甲、五甲、六甲、七甲等不同面积的土地，并以此为村名。
日据时期初期一度成立六甲支厅，以六甲为行政中心而得 名，辖六甲区、官田区、内庄区，约为今六甲、官田、大内三区。1920年实行五州制，成立六甲庄，隶台南州曾文郡管辖，与六甲区范围相当。战后再改为台南县六甲乡，2010年12月25日改称六甲区。