事件经过
2006年6月12日，“台湾红”公司的负责人李慧芬向台湾地区民意代表邱毅爆料，指她的300万新台币君悦饭店住宿发票，被她的堂姐李碧君拿去转交吴淑珍核销“国务机要费”。6月28日，审计部派员赴台湾当局领导人办公室查账，并将疑涉不法相关资料函送台湾高等法院检察署查缉黑金行动中心调查。负责此案的陈瑞仁检察官曾经讯问陈水扁、吴淑珍、马永成等人，要求他们就“国务机要费”的支出作出说明。 结果与起诉
2006年11月3日，中国台湾高等法院检察署书记官长张文政宣布“国务机要费”案侦查终结。检方认定：陈水扁与吴淑珍、马永成、林德训、陈镇慧四人均涉贪渎；涉及的6宗秘密外交案中，只有2宗是实案，其余1宗为虚构，3宗无关秘密外交费用。