直杆菌到球杆菌，直径0.5～0.8μm，长1～3μm。无芽孢。不形成荚膜，但在37℃生长或来自体内样品的细胞中的鼠疫耶尔森氏菌(Y．pestis)能产生包被。革兰氏阴性。37℃时不运动。生长在30℃以下时以周生鞭毛运动。 形态描述
鼠疫耶尔森氏菌总是不运动。在普通的营养培养基上生长。在营养琼脂上培养24h后，菌落半透明到不透明，直径0.1～1.0mm。最适生长温度28～29℃。兼性厌氧，既具有呼吸型代谢又具有发酵型代谢。氧化酶阴性，接触酶阳性。除了个别的生物变型(biovars)外，都能还原硝酸盐成亚硝酸盐。发酵葡萄糖和其他碳水化合物产酸，但不产气或产少量的气。表现特征常常与温度有关，一般培养在25～29℃比在37～39℃能呈现出更多的特征性。所研究过的种具有肠杆菌的常见抗原。生境很广泛(从有生命到无生命)，有些种适应于特异性寄主。 DNA的G+C mol%为46～50(Tm，Bd)。种间鉴别见表3-18。