第一次府院之争发生在1916年至1917年(民国五至六年)之间,由于北洋军阀的分裂,副总统黎元洪与控制北京政权的段祺瑞主要围绕两个问题展开矛盾:一是对德宣战问题;二是解散国会问题,结果是黎元洪和段祺瑞下台,冯国璋和徐世昌分别接任总统和总理,这一结果并没有解决府院之争的根本问题,而是导致了第二次府院之争的爆发。[1][3] 第二次府院之争发生在1918年1月至9月期间,占据国务院段祺瑞与占据总统府冯国璋主要围绕西南军阀的政策问题和安福国会选举总统的问题展开斗争。这场斗争最终导致了冯国璋和段祺瑞都下台,徐世昌当选为新任总统,没有解决府院之争的根本问题,导致北洋军阀之间的更大规模的战争。[1][2] 背景
中国国民党和南方的地方势力是黎元洪的依托,研究系、进步党和北洋督军是段祺瑞的基础。双方在国会制宪等问题上分歧严重。黎元洪一派主张扩大国会权限,以抵制段祺瑞的专断独行,研究系则反对省制入宪,主张缩小国会权利,改两院为一院,以迎合皖系军阀专制的私利。由于中国国民党议员在国会人多势众,研究系的议案屡遭否决。在国会表决中(国会议场在今西城境内),皖系军阀首领便策动北洋各省督军,粗暴干涉国会,恣意打击中国国民党人。